你说的是PCR产物的纯化syb green吧?
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离心,将含荧光定量PCR是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线反应过程,结合相应的软件可以对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度。|||原理不同:荧光定量pcr实时监测与dna结合的荧光染料激发的荧光;普通pcr通过检测插入dna中核算染料的量来测定pcr最终产物量,一般是紫外光。反应要求:荧光定量对扩增片段有较高的要求,一般为100-300bp;普通定量可以扩增长点的片段。如果不需要检测产物分子量大小,荧光定量可以不进行电泳就对产物进行定量分析,普通pcr必须电泳。结果:荧光定量可以实现定量,普通pcr则不行。荧光定量体现可以看到整个扩增过程,可以看到扩增效率,溶解温度,直接得到的标准曲线等,这些是普通pcr无法实现的。|||这个还真不大清楚|||貌似前者是定量,后者属于半定量。|||简单的讲PCR技术最早是用于扩增一段特异的PCR片段,用于克隆、测序等实验,后来也将其用于样本异的PCR片段有无或非很粗的相对定量,而荧光定量PCR技术则是为了测定样本异的PCR片段相对及量,是一种测定特异的PCR片段含量的方式。如测定病人样本中病原体的含量、实验样本中某一特定的mRNA的含量等。前些年有人讲过普通PCR后,通过电泳也可以进行定量,其实是将PCR产物的定量与PCR样本中模板定量相混了。近两年没有人再讲这类的话了。|||引物设计是sybr定量PCR法的难点,机会好的话,设计一对引物就能得到很好的结果,机会不好的话7、8对引物也出不来,我就遇到过这样的问题,我在prime5.0上设计了8对引物,符合实验要求的一对也没有,我把退火温度提高到了68度也没能把引物二聚体搞定,后来我想通了,可能我这对引物把其它序列扩增出来了,而且扩增效率很高(我一个同学设计了十几对才找到一对好用的)。记住primer5.0设计出来的好的引物,到了定量PCR上不一定好使,这是我的经验。定量pCR的引物对匹配度要求不高,我现在使用的引物就有几个碱基不匹配,但实验结果很好。有一个办法可以帮助我们绕过引物设计这道坎,直接到罗氏网站上专区上找引物。罗氏网站在线有一个引物设计软件,你只要找好你目的基因的种属,输入你的片段序列就可以得到你要的引物。这个软件有很大的好处,他会自动地把你的种属序列背景扣除,限度地去除引物二聚体产生的可以。琼脂糖的溶液去除;
1 过柱回收,利用XX膜吸附DNA;
有切胶和直接纯化2种方法比较常见。后一种方法用于只有单一产物的pcr。
qiagen公司有试剂盒
荧光染料包括饱和荧光染料和非饱和荧光染料,非饱和荧光染料的典型代表还有一种更简单的方法。跑胶时做一个两排孔的胶,加样在上排,当你要的条带跑到下排孔内时,断电,吸出样本就可以了。要点是缓冲液不能加太多,刚好和胶一样高。就是现在最常用的SYBR GreenⅠ;饱和荧光染料有EvaGreen、LC Green等
那么,引物的结构就是(5→3):保护碱基+酶切位点+原来的引物序列SYBR Green I是荧光定量PCR最常用的DNA结合染料,与双链DNA非特异性结合。在游离状态下,SYBR Green I发出微弱的荧光,但一旦与双链DNA结合,其荧光增加1000倍。所以,一个反应发出的全部荧光信号与出线的双链DNA量呈比列,且会随扩增产物的增加而增加
RT-PCR验证是逆转录组测序的一个步骤,逆转录组测序包含RT-PCR验证。
具体的问人家试剂公司吧